温室工程内的通风系统可以排出温室内多余的热量，控制温度；同时也能带出多余的湿度，使温室的温度和湿度达到作物生长适宜的范围。

一般温室工程的通风系统包含自然通风和机械通风。自然通风就是我们常说的顶窗或者侧窗通风，通过人工配置通风窗，外设防虫网在温度超过一定范围后打开通风窗通风。
机械通风一般是在温室工程侧壁安设排气扇，通过排气扇降温排出湿气。